Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmbr1lQ9D1E5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmbr1lQ9D1E5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmbr1lQ9D1E5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmbr1lQ9D1E5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmbr1lQ9D1E5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmbr1lQ9D1E5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmbr1lQ9D1E5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmbr1lQ9D1E5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmbr1lQ9D1E5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmbr1lQ9D1E5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmbr1lQ9D1E5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmbr1lQ9D1E5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmbr1lQ9D1E5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmbr1lQ9D1E5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lmbr1lQ9D1E5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lmbr1lQ9D1E5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lmbr1lQ9D1E5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lmbr1lQ9D1E5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lmbr1lQ9D1E5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lmbr1lQ9D1E5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lmbr1lQ9D1E5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lmbr1lQ9D1E5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lmbr1lQ9D1E5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lmbr1lQ9D1E5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmbr1lQ9D1E5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmbr1lQ9D1E5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmbr1lQ9D1E5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmbr1lQ9D1E5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmbr1lQ9D1E5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmbr1lQ9D1E5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmbr1lQ9D1E5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmbr1lQ9D1E5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmbr1lQ9D1E5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmbr1lQ9D1E5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmbr1lQ9D1E5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmbr1lQ9D1E5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmbr1lQ9D1E5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmbr1lQ9D1E5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmbr1lQ9D1E5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmbr1lQ9D1E5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmbr1lQ9D1E5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lmbr1lQ9D1E5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lmbr1lQ9D1E5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lmbr1lQ9D1E5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lmbr1lQ9D1E5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lmbr1lQ9D1E5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lmbr1lQ9D1E5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmbr1lQ9D1E5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmbr1lQ9D1E5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmbr1lQ9D1E5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmbr1lQ9D1E5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmbr1lQ9D1E5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmbr1lQ9D1E5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmbr1lQ9D1E5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmbr1lQ9D1E5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmbr1lQ9D1E5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmbr1lQ9D1E5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmbr1lQ9D1E5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmbr1lQ9D1E5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmbr1lQ9D1E5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmbr1lQ9D1E5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmbr1lQ9D1E5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmbr1lQ9D1E5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmbr1lQ9D1E5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmbr1lQ9D1E5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmbr1lQ9D1E5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmbr1lQ9D1E5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmbr1lQ9D1E5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmbr1lQ9D1E5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmbr1lQ9D1E5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmbr1lQ9D1E5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmbr1lQ9D1E5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmbr1lQ9D1E5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmbr1lQ9D1E5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmbr1lQ9D1E5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmbr1lQ9D1E5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmbr1lQ9D1E5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmbr1lQ9D1E5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmbr1lQ9D1E5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmbr1lQ9D1E5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmbr1lQ9D1E5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmbr1lQ9D1E5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmbr1lQ9D1E5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmbr1lQ9D1E5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmbr1lQ9D1E5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmbr1lQ9D1E5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmbr1lQ9D1E5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmbr1lQ9D1E5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmbr1lQ9D1E5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmbr1lQ9D1E5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmbr1lQ9D1E5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmbr1lQ9D1E5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmbr1lQ9D1E5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms