Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0T1

Snu13, NHP2-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snu13Q9D0T1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snu13Q9D0T1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 398.9 ms