Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ1

Utp11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp11Q9CZJ1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms