Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT8

Pmpcb, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmpcbQ9CXT8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PmpcbQ9CXT8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PmpcbQ9CXT8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PmpcbQ9CXT8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PmpcbQ9CXT8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PmpcbQ9CXT8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PmpcbQ9CXT8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PmpcbQ9CXT8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PmpcbQ9CXT8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PmpcbQ9CXT8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PmpcbQ9CXT8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PmpcbQ9CXT8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PmpcbQ9CXT8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PmpcbQ9CXT8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PmpcbQ9CXT8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PmpcbQ9CXT8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PmpcbQ9CXT8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PmpcbQ9CXT8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PmpcbQ9CXT8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PmpcbQ9CXT8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PmpcbQ9CXT8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PmpcbQ9CXT8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PmpcbQ9CXT8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PmpcbQ9CXT8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PmpcbQ9CXT8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PmpcbQ9CXT8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PmpcbQ9CXT8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PmpcbQ9CXT8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PmpcbQ9CXT8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PmpcbQ9CXT8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PmpcbQ9CXT8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PmpcbQ9CXT8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PmpcbQ9CXT8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PmpcbQ9CXT8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PmpcbQ9CXT8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PmpcbQ9CXT8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PmpcbQ9CXT8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PmpcbQ9CXT8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PmpcbQ9CXT8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PmpcbQ9CXT8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PmpcbQ9CXT8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PmpcbQ9CXT8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PmpcbQ9CXT8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PmpcbQ9CXT8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PmpcbQ9CXT8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PmpcbQ9CXT8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PmpcbQ9CXT8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PmpcbQ9CXT8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PmpcbQ9CXT8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PmpcbQ9CXT8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PmpcbQ9CXT8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PmpcbQ9CXT8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PmpcbQ9CXT8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PmpcbQ9CXT8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PmpcbQ9CXT8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PmpcbQ9CXT8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PmpcbQ9CXT8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PmpcbQ9CXT8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PmpcbQ9CXT8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PmpcbQ9CXT8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PmpcbQ9CXT8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PmpcbQ9CXT8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PmpcbQ9CXT8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PmpcbQ9CXT8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PmpcbQ9CXT8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PmpcbQ9CXT8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PmpcbQ9CXT8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PmpcbQ9CXT8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PmpcbQ9CXT8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PmpcbQ9CXT8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PmpcbQ9CXT8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PmpcbQ9CXT8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PmpcbQ9CXT8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PmpcbQ9CXT8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PmpcbQ9CXT8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PmpcbQ9CXT8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PmpcbQ9CXT8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PmpcbQ9CXT8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PmpcbQ9CXT8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PmpcbQ9CXT8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PmpcbQ9CXT8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PmpcbQ9CXT8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PmpcbQ9CXT8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PmpcbQ9CXT8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PmpcbQ9CXT8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PmpcbQ9CXT8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PmpcbQ9CXT8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PmpcbQ9CXT8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PmpcbQ9CXT8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PmpcbQ9CXT8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PmpcbQ9CXT8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PmpcbQ9CXT8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PmpcbQ9CXT8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PmpcbQ9CXT8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PmpcbQ9CXT8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PmpcbQ9CXT8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PmpcbQ9CXT8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PmpcbQ9CXT8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PmpcbQ9CXT8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PmpcbQ9CXT8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms