Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX13

Cnih4, Protein cornichon homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih4Q9CX13 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms