Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tdrd12Q9CWU0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Tdrd12Q9CWU0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tdrd12Q9CWU0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tdrd12Q9CWU0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Tdrd12Q9CWU0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tdrd12Q9CWU0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tdrd12Q9CWU0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tdrd12Q9CWU0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tdrd12Q9CWU0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Tdrd12Q9CWU0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tdrd12Q9CWU0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms