Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rhobtb3Q9CTN4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Rhobtb3Q9CTN4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rhobtb3Q9CTN4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rhobtb3Q9CTN4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rhobtb3Q9CTN4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rhobtb3Q9CTN4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rhobtb3Q9CTN4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rhobtb3Q9CTN4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rhobtb3Q9CTN4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rhobtb3Q9CTN4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rhobtb3Q9CTN4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rhobtb3Q9CTN4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rhobtb3Q9CTN4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rhobtb3Q9CTN4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rhobtb3Q9CTN4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rhobtb3Q9CTN4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rhobtb3Q9CTN4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rhobtb3Q9CTN4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rhobtb3Q9CTN4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Rhobtb3Q9CTN4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rhobtb3Q9CTN4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rhobtb3Q9CTN4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rhobtb3Q9CTN4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rhobtb3Q9CTN4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rhobtb3Q9CTN4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Rhobtb3Q9CTN4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rhobtb3Q9CTN4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rhobtb3Q9CTN4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rhobtb3Q9CTN4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rhobtb3Q9CTN4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms