Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA9

Fgfr1op2, FGFR1 oncogene partner 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr1op2Q9CRA9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fgfr1op2Q9CRA9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fgfr1op2Q9CRA9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fgfr1op2Q9CRA9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgfr1op2Q9CRA9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgfr1op2Q9CRA9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgfr1op2Q9CRA9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgfr1op2Q9CRA9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgfr1op2Q9CRA9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgfr1op2Q9CRA9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgfr1op2Q9CRA9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgfr1op2Q9CRA9 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgfr1op2Q9CRA9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgfr1op2Q9CRA9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgfr1op2Q9CRA9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgfr1op2Q9CRA9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgfr1op2Q9CRA9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgfr1op2Q9CRA9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgfr1op2Q9CRA9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgfr1op2Q9CRA9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgfr1op2Q9CRA9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgfr1op2Q9CRA9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgfr1op2Q9CRA9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgfr1op2Q9CRA9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgfr1op2Q9CRA9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgfr1op2Q9CRA9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgfr1op2Q9CRA9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgfr1op2Q9CRA9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgfr1op2Q9CRA9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgfr1op2Q9CRA9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgfr1op2Q9CRA9 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgfr1op2Q9CRA9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgfr1op2Q9CRA9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgfr1op2Q9CRA9 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgfr1op2Q9CRA9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgfr1op2Q9CRA9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgfr1op2Q9CRA9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgfr1op2Q9CRA9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgfr1op2Q9CRA9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgfr1op2Q9CRA9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgfr1op2Q9CRA9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgfr1op2Q9CRA9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgfr1op2Q9CRA9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgfr1op2Q9CRA9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgfr1op2Q9CRA9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgfr1op2Q9CRA9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgfr1op2Q9CRA9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgfr1op2Q9CRA9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgfr1op2Q9CRA9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgfr1op2Q9CRA9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgfr1op2Q9CRA9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgfr1op2Q9CRA9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgfr1op2Q9CRA9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fgfr1op2Q9CRA9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fgfr1op2Q9CRA9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fgfr1op2Q9CRA9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Fgfr1op2Q9CRA9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fgfr1op2Q9CRA9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fgfr1op2Q9CRA9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fgfr1op2Q9CRA9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fgfr1op2Q9CRA9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fgfr1op2Q9CRA9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fgfr1op2Q9CRA9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fgfr1op2Q9CRA9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fgfr1op2Q9CRA9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fgfr1op2Q9CRA9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fgfr1op2Q9CRA9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fgfr1op2Q9CRA9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fgfr1op2Q9CRA9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fgfr1op2Q9CRA9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fgfr1op2Q9CRA9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fgfr1op2Q9CRA9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fgfr1op2Q9CRA9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fgfr1op2Q9CRA9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fgfr1op2Q9CRA9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fgfr1op2Q9CRA9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fgfr1op2Q9CRA9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fgfr1op2Q9CRA9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fgfr1op2Q9CRA9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Fgfr1op2Q9CRA9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgfr1op2Q9CRA9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgfr1op2Q9CRA9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgfr1op2Q9CRA9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgfr1op2Q9CRA9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgfr1op2Q9CRA9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgfr1op2Q9CRA9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgfr1op2Q9CRA9 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgfr1op2Q9CRA9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgfr1op2Q9CRA9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgfr1op2Q9CRA9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgfr1op2Q9CRA9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgfr1op2Q9CRA9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgfr1op2Q9CRA9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgfr1op2Q9CRA9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgfr1op2Q9CRA9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgfr1op2Q9CRA9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgfr1op2Q9CRA9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgfr1op2Q9CRA9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgfr1op2Q9CRA9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgfr1op2Q9CRA9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms