Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR52

4933400A11Rik, RIKEN cDNA 4933400A11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933400A11RikQ9CR52 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms