Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM2

Kdelr2, ER lumen protein-retaining receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdelr2Q9CQM2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kdelr2Q9CQM2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kdelr2Q9CQM2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kdelr2Q9CQM2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kdelr2Q9CQM2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kdelr2Q9CQM2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kdelr2Q9CQM2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kdelr2Q9CQM2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kdelr2Q9CQM2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kdelr2Q9CQM2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms