Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ90

Uncharacterized protein C9orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQ90 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CQ90 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CQ90 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CQ90 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CQ90 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CQ90 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CQ90 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CQ90 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CQ90 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CQ90 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CQ90 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CQ90 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CQ90 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CQ90 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CQ90 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CQ90 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CQ90 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CQ90 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CQ90 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CQ90 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CQ90 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CQ90 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CQ90 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CQ90 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CQ90 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CQ90 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CQ90 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CQ90 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CQ90 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CQ90 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CQ90 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CQ90 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CQ90 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CQ90 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CQ90 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CQ90 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CQ90 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CQ90 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CQ90 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CQ90 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CQ90 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CQ90 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CQ90 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CQ90 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CQ90 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CQ90 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CQ90 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CQ90 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CQ90 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CQ90 Gm12962-202ENSMUST00000144212 691 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CQ90 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CQ90 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CQ90 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CQ90 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CQ90 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CQ90 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CQ90 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CQ90 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CQ90 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CQ90 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CQ90 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CQ90 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CQ90 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CQ90 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CQ90 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CQ90 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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