Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms