Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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