Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms