Protein–RNA interactions for Protein: Q99P58

Rab27b, Ras-related protein Rab-27B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab27bQ99P58 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms