Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB1

Acss1, Acetyl-coenzyme A synthetase 2-like, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acss1Q99NB1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Acss1Q99NB1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Acss1Q99NB1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Acss1Q99NB1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Acss1Q99NB1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Acss1Q99NB1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Acss1Q99NB1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Acss1Q99NB1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Acss1Q99NB1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Acss1Q99NB1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acss1Q99NB1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acss1Q99NB1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acss1Q99NB1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acss1Q99NB1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acss1Q99NB1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acss1Q99NB1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acss1Q99NB1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acss1Q99NB1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acss1Q99NB1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acss1Q99NB1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acss1Q99NB1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acss1Q99NB1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acss1Q99NB1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acss1Q99NB1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acss1Q99NB1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acss1Q99NB1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acss1Q99NB1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acss1Q99NB1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acss1Q99NB1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acss1Q99NB1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acss1Q99NB1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acss1Q99NB1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acss1Q99NB1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Acss1Q99NB1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acss1Q99NB1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acss1Q99NB1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acss1Q99NB1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acss1Q99NB1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acss1Q99NB1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acss1Q99NB1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acss1Q99NB1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acss1Q99NB1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acss1Q99NB1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acss1Q99NB1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acss1Q99NB1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acss1Q99NB1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acss1Q99NB1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acss1Q99NB1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acss1Q99NB1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acss1Q99NB1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acss1Q99NB1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acss1Q99NB1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acss1Q99NB1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acss1Q99NB1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acss1Q99NB1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acss1Q99NB1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acss1Q99NB1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acss1Q99NB1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Acss1Q99NB1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acss1Q99NB1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acss1Q99NB1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acss1Q99NB1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acss1Q99NB1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acss1Q99NB1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acss1Q99NB1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acss1Q99NB1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Acss1Q99NB1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Acss1Q99NB1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Acss1Q99NB1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Acss1Q99NB1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Acss1Q99NB1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Acss1Q99NB1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Acss1Q99NB1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Acss1Q99NB1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Acss1Q99NB1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms