Protein–RNA interactions for Protein: Q99N07

Ms4a6d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6D, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6dQ99N07 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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