Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
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Ms4a4dQ99N05 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ms4a4dQ99N05 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ms4a4dQ99N05 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ms4a4dQ99N05 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ms4a4dQ99N05 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ms4a4dQ99N05 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Ms4a4dQ99N05 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ms4a4dQ99N05 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ms4a4dQ99N05 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ms4a4dQ99N05 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ms4a4dQ99N05 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ms4a4dQ99N05 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ms4a4dQ99N05 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ms4a4dQ99N05 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ms4a4dQ99N05 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ms4a4dQ99N05 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ms4a4dQ99N05 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ms4a4dQ99N05 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Ms4a4dQ99N05 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ms4a4dQ99N05 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ms4a4dQ99N05 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ms4a4dQ99N05 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Ms4a4dQ99N05 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ms4a4dQ99N05 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Ms4a4dQ99N05 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Ms4a4dQ99N05 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ms4a4dQ99N05 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Ms4a4dQ99N05 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Ms4a4dQ99N05 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a4dQ99N05 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Ms4a4dQ99N05 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Ms4a4dQ99N05 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Ms4a4dQ99N05 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Ms4a4dQ99N05 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Ms4a4dQ99N05 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Ms4a4dQ99N05 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ms4a4dQ99N05 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ms4a4dQ99N05 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ms4a4dQ99N05 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ms4a4dQ99N05 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ms4a4dQ99N05 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ms4a4dQ99N05 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
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Ms4a4dQ99N05 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ms4a4dQ99N05 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ms4a4dQ99N05 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ms4a4dQ99N05 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ms4a4dQ99N05 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ms4a4dQ99N05 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ms4a4dQ99N05 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ms4a4dQ99N05 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ms4a4dQ99N05 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ms4a4dQ99N05 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ms4a4dQ99N05 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ms4a4dQ99N05 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ms4a4dQ99N05 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Ms4a4dQ99N05 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms