Protein–RNA interactions for Protein: Q99ML1

Bbc3, Bcl-2-binding component 3, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbc3Q99ML1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms