Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms