Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Apobec3Q99J72 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Apobec3Q99J72 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Apobec3Q99J72 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Apobec3Q99J72 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Apobec3Q99J72 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Apobec3Q99J72 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Apobec3Q99J72 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Apobec3Q99J72 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Apobec3Q99J72 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Apobec3Q99J72 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Apobec3Q99J72 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Apobec3Q99J72 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Apobec3Q99J72 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Apobec3Q99J72 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Apobec3Q99J72 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Apobec3Q99J72 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Apobec3Q99J72 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Apobec3Q99J72 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Apobec3Q99J72 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Apobec3Q99J72 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Apobec3Q99J72 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Apobec3Q99J72 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Apobec3Q99J72 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Apobec3Q99J72 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Apobec3Q99J72 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Apobec3Q99J72 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Apobec3Q99J72 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Apobec3Q99J72 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Apobec3Q99J72 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Apobec3Q99J72 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Apobec3Q99J72 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Apobec3Q99J72 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Apobec3Q99J72 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apobec3Q99J72 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apobec3Q99J72 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apobec3Q99J72 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apobec3Q99J72 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Apobec3Q99J72 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apobec3Q99J72 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Apobec3Q99J72 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Apobec3Q99J72 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apobec3Q99J72 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Apobec3Q99J72 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apobec3Q99J72 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apobec3Q99J72 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Apobec3Q99J72 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Apobec3Q99J72 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apobec3Q99J72 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apobec3Q99J72 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Apobec3Q99J72 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apobec3Q99J72 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Apobec3Q99J72 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Apobec3Q99J72 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Apobec3Q99J72 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Apobec3Q99J72 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Apobec3Q99J72 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Apobec3Q99J72 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Apobec3Q99J72 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Apobec3Q99J72 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
Apobec3Q99J72 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
Apobec3Q99J72 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Apobec3Q99J72 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Apobec3Q99J72 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Apobec3Q99J72 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Apobec3Q99J72 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Apobec3Q99J72 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Apobec3Q99J72 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Apobec3Q99J72 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Apobec3Q99J72 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Apobec3Q99J72 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Apobec3Q99J72 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Apobec3Q99J72 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Apobec3Q99J72 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apobec3Q99J72 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apobec3Q99J72 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apobec3Q99J72 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apobec3Q99J72 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apobec3Q99J72 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apobec3Q99J72 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apobec3Q99J72 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apobec3Q99J72 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apobec3Q99J72 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apobec3Q99J72 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apobec3Q99J72 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apobec3Q99J72 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apobec3Q99J72 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apobec3Q99J72 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apobec3Q99J72 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apobec3Q99J72 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apobec3Q99J72 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apobec3Q99J72 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apobec3Q99J72 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apobec3Q99J72 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apobec3Q99J72 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apobec3Q99J72 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apobec3Q99J72 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apobec3Q99J72 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apobec3Q99J72 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Apobec3Q99J72 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms