Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b5Q923D4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms