Protein–RNA interactions for Protein: Q91YY4

Atpaf2, ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atpaf2Q91YY4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atpaf2Q91YY4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atpaf2Q91YY4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atpaf2Q91YY4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atpaf2Q91YY4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atpaf2Q91YY4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atpaf2Q91YY4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atpaf2Q91YY4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atpaf2Q91YY4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Atpaf2Q91YY4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atpaf2Q91YY4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Atpaf2Q91YY4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atpaf2Q91YY4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atpaf2Q91YY4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atpaf2Q91YY4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atpaf2Q91YY4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atpaf2Q91YY4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atpaf2Q91YY4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atpaf2Q91YY4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atpaf2Q91YY4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atpaf2Q91YY4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atpaf2Q91YY4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atpaf2Q91YY4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atpaf2Q91YY4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atpaf2Q91YY4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atpaf2Q91YY4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atpaf2Q91YY4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atpaf2Q91YY4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atpaf2Q91YY4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atpaf2Q91YY4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atpaf2Q91YY4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atpaf2Q91YY4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atpaf2Q91YY4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atpaf2Q91YY4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atpaf2Q91YY4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Atpaf2Q91YY4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atpaf2Q91YY4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atpaf2Q91YY4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atpaf2Q91YY4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atpaf2Q91YY4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atpaf2Q91YY4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atpaf2Q91YY4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atpaf2Q91YY4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Atpaf2Q91YY4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atpaf2Q91YY4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atpaf2Q91YY4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atpaf2Q91YY4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atpaf2Q91YY4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atpaf2Q91YY4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atpaf2Q91YY4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atpaf2Q91YY4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atpaf2Q91YY4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atpaf2Q91YY4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atpaf2Q91YY4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Atpaf2Q91YY4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Atpaf2Q91YY4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Atpaf2Q91YY4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Atpaf2Q91YY4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atpaf2Q91YY4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atpaf2Q91YY4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atpaf2Q91YY4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atpaf2Q91YY4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atpaf2Q91YY4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atpaf2Q91YY4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atpaf2Q91YY4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atpaf2Q91YY4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atpaf2Q91YY4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atpaf2Q91YY4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atpaf2Q91YY4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atpaf2Q91YY4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atpaf2Q91YY4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atpaf2Q91YY4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atpaf2Q91YY4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Atpaf2Q91YY4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atpaf2Q91YY4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atpaf2Q91YY4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atpaf2Q91YY4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atpaf2Q91YY4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atpaf2Q91YY4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atpaf2Q91YY4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atpaf2Q91YY4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atpaf2Q91YY4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Atpaf2Q91YY4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Atpaf2Q91YY4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Atpaf2Q91YY4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Atpaf2Q91YY4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atpaf2Q91YY4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atpaf2Q91YY4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atpaf2Q91YY4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Atpaf2Q91YY4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Atpaf2Q91YY4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atpaf2Q91YY4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atpaf2Q91YY4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atpaf2Q91YY4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atpaf2Q91YY4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atpaf2Q91YY4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atpaf2Q91YY4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atpaf2Q91YY4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atpaf2Q91YY4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Atpaf2Q91YY4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms