Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atl3Q91YH5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atl3Q91YH5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atl3Q91YH5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atl3Q91YH5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atl3Q91YH5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atl3Q91YH5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atl3Q91YH5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atl3Q91YH5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atl3Q91YH5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atl3Q91YH5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atl3Q91YH5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atl3Q91YH5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Atl3Q91YH5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atl3Q91YH5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atl3Q91YH5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atl3Q91YH5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atl3Q91YH5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atl3Q91YH5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atl3Q91YH5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atl3Q91YH5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atl3Q91YH5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Atl3Q91YH5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atl3Q91YH5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atl3Q91YH5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atl3Q91YH5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atl3Q91YH5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atl3Q91YH5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atl3Q91YH5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atl3Q91YH5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atl3Q91YH5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atl3Q91YH5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atl3Q91YH5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atl3Q91YH5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atl3Q91YH5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atl3Q91YH5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Atl3Q91YH5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Atl3Q91YH5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Atl3Q91YH5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atl3Q91YH5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atl3Q91YH5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atl3Q91YH5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atl3Q91YH5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atl3Q91YH5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atl3Q91YH5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atl3Q91YH5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atl3Q91YH5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Atl3Q91YH5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atl3Q91YH5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atl3Q91YH5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atl3Q91YH5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atl3Q91YH5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atl3Q91YH5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atl3Q91YH5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atl3Q91YH5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atl3Q91YH5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atl3Q91YH5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atl3Q91YH5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atl3Q91YH5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atl3Q91YH5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atl3Q91YH5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atl3Q91YH5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atl3Q91YH5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atl3Q91YH5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atl3Q91YH5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atl3Q91YH5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atl3Q91YH5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atl3Q91YH5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atl3Q91YH5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atl3Q91YH5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atl3Q91YH5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atl3Q91YH5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atl3Q91YH5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atl3Q91YH5 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atl3Q91YH5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atl3Q91YH5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atl3Q91YH5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atl3Q91YH5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atl3Q91YH5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Atl3Q91YH5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atl3Q91YH5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atl3Q91YH5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atl3Q91YH5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atl3Q91YH5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atl3Q91YH5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atl3Q91YH5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atl3Q91YH5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atl3Q91YH5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atl3Q91YH5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atl3Q91YH5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atl3Q91YH5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atl3Q91YH5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atl3Q91YH5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atl3Q91YH5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atl3Q91YH5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atl3Q91YH5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atl3Q91YH5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atl3Q91YH5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atl3Q91YH5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atl3Q91YH5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms