Protein–RNA interactions for Protein: Q91WL6

Snx11, Sorting nexin-11, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx11Q91WL6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx11Q91WL6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx11Q91WL6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx11Q91WL6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx11Q91WL6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx11Q91WL6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx11Q91WL6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx11Q91WL6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx11Q91WL6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx11Q91WL6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx11Q91WL6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx11Q91WL6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx11Q91WL6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx11Q91WL6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx11Q91WL6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx11Q91WL6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx11Q91WL6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx11Q91WL6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx11Q91WL6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx11Q91WL6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx11Q91WL6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx11Q91WL6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx11Q91WL6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx11Q91WL6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx11Q91WL6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx11Q91WL6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx11Q91WL6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snx11Q91WL6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snx11Q91WL6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snx11Q91WL6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Snx11Q91WL6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snx11Q91WL6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snx11Q91WL6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx11Q91WL6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx11Q91WL6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx11Q91WL6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx11Q91WL6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx11Q91WL6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx11Q91WL6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx11Q91WL6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx11Q91WL6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx11Q91WL6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx11Q91WL6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx11Q91WL6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx11Q91WL6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx11Q91WL6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx11Q91WL6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx11Q91WL6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx11Q91WL6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx11Q91WL6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx11Q91WL6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx11Q91WL6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx11Q91WL6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx11Q91WL6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx11Q91WL6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx11Q91WL6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx11Q91WL6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx11Q91WL6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx11Q91WL6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx11Q91WL6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx11Q91WL6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx11Q91WL6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx11Q91WL6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx11Q91WL6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx11Q91WL6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx11Q91WL6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx11Q91WL6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx11Q91WL6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx11Q91WL6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx11Q91WL6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx11Q91WL6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx11Q91WL6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx11Q91WL6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx11Q91WL6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx11Q91WL6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx11Q91WL6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx11Q91WL6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx11Q91WL6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx11Q91WL6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx11Q91WL6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx11Q91WL6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx11Q91WL6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx11Q91WL6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx11Q91WL6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx11Q91WL6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx11Q91WL6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx11Q91WL6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx11Q91WL6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx11Q91WL6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx11Q91WL6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx11Q91WL6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx11Q91WL6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx11Q91WL6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx11Q91WL6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx11Q91WL6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx11Q91WL6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx11Q91WL6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx11Q91WL6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx11Q91WL6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx11Q91WL6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms