Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHW2

Cacng8, Voltage-dependent calcium channel gamma-8 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng8Q8VHW2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 167.3 ms