Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD57

Sft2d2, Vesicle transport protein SFT2B, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d2Q8VD57 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms