Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC88

Gca, Grancalcin, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcaQ8VC88 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GcaQ8VC88 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GcaQ8VC88 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GcaQ8VC88 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GcaQ8VC88 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GcaQ8VC88 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GcaQ8VC88 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GcaQ8VC88 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GcaQ8VC88 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GcaQ8VC88 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GcaQ8VC88 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GcaQ8VC88 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GcaQ8VC88 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GcaQ8VC88 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GcaQ8VC88 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GcaQ8VC88 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GcaQ8VC88 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GcaQ8VC88 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GcaQ8VC88 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GcaQ8VC88 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GcaQ8VC88 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GcaQ8VC88 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GcaQ8VC88 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GcaQ8VC88 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GcaQ8VC88 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GcaQ8VC88 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GcaQ8VC88 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GcaQ8VC88 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GcaQ8VC88 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GcaQ8VC88 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GcaQ8VC88 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GcaQ8VC88 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GcaQ8VC88 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GcaQ8VC88 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GcaQ8VC88 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GcaQ8VC88 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GcaQ8VC88 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GcaQ8VC88 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GcaQ8VC88 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GcaQ8VC88 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GcaQ8VC88 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GcaQ8VC88 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GcaQ8VC88 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GcaQ8VC88 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GcaQ8VC88 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GcaQ8VC88 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GcaQ8VC88 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GcaQ8VC88 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GcaQ8VC88 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GcaQ8VC88 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GcaQ8VC88 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GcaQ8VC88 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GcaQ8VC88 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GcaQ8VC88 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GcaQ8VC88 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GcaQ8VC88 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GcaQ8VC88 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GcaQ8VC88 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GcaQ8VC88 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GcaQ8VC88 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GcaQ8VC88 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GcaQ8VC88 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GcaQ8VC88 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GcaQ8VC88 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GcaQ8VC88 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GcaQ8VC88 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GcaQ8VC88 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GcaQ8VC88 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GcaQ8VC88 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GcaQ8VC88 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GcaQ8VC88 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GcaQ8VC88 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GcaQ8VC88 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GcaQ8VC88 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GcaQ8VC88 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms