Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC31

Ccdc9, Coiled-coil domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9Q8VC31 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc9Q8VC31 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc9Q8VC31 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc9Q8VC31 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc9Q8VC31 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc9Q8VC31 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc9Q8VC31 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc9Q8VC31 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc9Q8VC31 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc9Q8VC31 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc9Q8VC31 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc9Q8VC31 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc9Q8VC31 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc9Q8VC31 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc9Q8VC31 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ccdc9Q8VC31 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc9Q8VC31 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc9Q8VC31 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc9Q8VC31 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc9Q8VC31 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc9Q8VC31 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc9Q8VC31 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc9Q8VC31 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc9Q8VC31 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc9Q8VC31 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc9Q8VC31 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc9Q8VC31 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc9Q8VC31 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc9Q8VC31 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc9Q8VC31 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc9Q8VC31 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc9Q8VC31 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc9Q8VC31 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc9Q8VC31 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc9Q8VC31 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc9Q8VC31 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc9Q8VC31 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc9Q8VC31 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc9Q8VC31 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc9Q8VC31 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc9Q8VC31 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc9Q8VC31 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc9Q8VC31 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc9Q8VC31 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc9Q8VC31 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc9Q8VC31 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc9Q8VC31 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc9Q8VC31 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc9Q8VC31 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc9Q8VC31 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc9Q8VC31 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc9Q8VC31 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc9Q8VC31 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc9Q8VC31 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc9Q8VC31 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc9Q8VC31 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc9Q8VC31 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc9Q8VC31 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc9Q8VC31 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc9Q8VC31 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc9Q8VC31 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc9Q8VC31 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc9Q8VC31 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc9Q8VC31 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc9Q8VC31 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc9Q8VC31 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc9Q8VC31 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc9Q8VC31 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc9Q8VC31 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc9Q8VC31 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc9Q8VC31 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc9Q8VC31 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc9Q8VC31 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc9Q8VC31 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc9Q8VC31 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc9Q8VC31 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc9Q8VC31 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc9Q8VC31 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc9Q8VC31 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc9Q8VC31 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc9Q8VC31 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc9Q8VC31 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc9Q8VC31 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc9Q8VC31 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc9Q8VC31 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc9Q8VC31 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc9Q8VC31 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc9Q8VC31 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc9Q8VC31 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc9Q8VC31 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc9Q8VC31 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc9Q8VC31 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc9Q8VC31 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc9Q8VC31 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc9Q8VC31 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc9Q8VC31 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc9Q8VC31 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc9Q8VC31 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc9Q8VC31 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc9Q8VC31 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms