Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BbxQ8VBW5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BbxQ8VBW5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BbxQ8VBW5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BbxQ8VBW5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BbxQ8VBW5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BbxQ8VBW5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BbxQ8VBW5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BbxQ8VBW5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BbxQ8VBW5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BbxQ8VBW5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BbxQ8VBW5 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BbxQ8VBW5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BbxQ8VBW5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BbxQ8VBW5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BbxQ8VBW5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
BbxQ8VBW5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms