Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trim29Q8R2Q0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trim29Q8R2Q0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trim29Q8R2Q0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim29Q8R2Q0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim29Q8R2Q0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim29Q8R2Q0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim29Q8R2Q0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim29Q8R2Q0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim29Q8R2Q0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim29Q8R2Q0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim29Q8R2Q0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim29Q8R2Q0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim29Q8R2Q0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim29Q8R2Q0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim29Q8R2Q0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim29Q8R2Q0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim29Q8R2Q0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim29Q8R2Q0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim29Q8R2Q0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim29Q8R2Q0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim29Q8R2Q0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim29Q8R2Q0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim29Q8R2Q0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim29Q8R2Q0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim29Q8R2Q0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.6 ms