Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms