Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y9

Ccm2, Cerebral cavernous malformations protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2Q8K2Y9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccm2Q8K2Y9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccm2Q8K2Y9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccm2Q8K2Y9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccm2Q8K2Y9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccm2Q8K2Y9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccm2Q8K2Y9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccm2Q8K2Y9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccm2Q8K2Y9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccm2Q8K2Y9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccm2Q8K2Y9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccm2Q8K2Y9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccm2Q8K2Y9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccm2Q8K2Y9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccm2Q8K2Y9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccm2Q8K2Y9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccm2Q8K2Y9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccm2Q8K2Y9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccm2Q8K2Y9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccm2Q8K2Y9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccm2Q8K2Y9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccm2Q8K2Y9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccm2Q8K2Y9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccm2Q8K2Y9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccm2Q8K2Y9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccm2Q8K2Y9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccm2Q8K2Y9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccm2Q8K2Y9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccm2Q8K2Y9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccm2Q8K2Y9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccm2Q8K2Y9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccm2Q8K2Y9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccm2Q8K2Y9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccm2Q8K2Y9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccm2Q8K2Y9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccm2Q8K2Y9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccm2Q8K2Y9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccm2Q8K2Y9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccm2Q8K2Y9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccm2Q8K2Y9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccm2Q8K2Y9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccm2Q8K2Y9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccm2Q8K2Y9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccm2Q8K2Y9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccm2Q8K2Y9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccm2Q8K2Y9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccm2Q8K2Y9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccm2Q8K2Y9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccm2Q8K2Y9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccm2Q8K2Y9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccm2Q8K2Y9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccm2Q8K2Y9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccm2Q8K2Y9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccm2Q8K2Y9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccm2Q8K2Y9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccm2Q8K2Y9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccm2Q8K2Y9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccm2Q8K2Y9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccm2Q8K2Y9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccm2Q8K2Y9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccm2Q8K2Y9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccm2Q8K2Y9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccm2Q8K2Y9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccm2Q8K2Y9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccm2Q8K2Y9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccm2Q8K2Y9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccm2Q8K2Y9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccm2Q8K2Y9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccm2Q8K2Y9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccm2Q8K2Y9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccm2Q8K2Y9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccm2Q8K2Y9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccm2Q8K2Y9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccm2Q8K2Y9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccm2Q8K2Y9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccm2Q8K2Y9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccm2Q8K2Y9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccm2Q8K2Y9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccm2Q8K2Y9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccm2Q8K2Y9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccm2Q8K2Y9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms