Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2I9

Fbxo18, F-box DNA helicase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo18Q8K2I9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fbxo18Q8K2I9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fbxo18Q8K2I9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fbxo18Q8K2I9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fbxo18Q8K2I9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Fbxo18Q8K2I9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fbxo18Q8K2I9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fbxo18Q8K2I9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fbxo18Q8K2I9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fbxo18Q8K2I9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fbxo18Q8K2I9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fbxo18Q8K2I9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fbxo18Q8K2I9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fbxo18Q8K2I9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fbxo18Q8K2I9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fbxo18Q8K2I9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fbxo18Q8K2I9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fbxo18Q8K2I9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fbxo18Q8K2I9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fbxo18Q8K2I9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fbxo18Q8K2I9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fbxo18Q8K2I9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fbxo18Q8K2I9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fbxo18Q8K2I9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fbxo18Q8K2I9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fbxo18Q8K2I9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fbxo18Q8K2I9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fbxo18Q8K2I9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fbxo18Q8K2I9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fbxo18Q8K2I9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fbxo18Q8K2I9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fbxo18Q8K2I9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fbxo18Q8K2I9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fbxo18Q8K2I9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fbxo18Q8K2I9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fbxo18Q8K2I9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fbxo18Q8K2I9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fbxo18Q8K2I9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fbxo18Q8K2I9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fbxo18Q8K2I9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fbxo18Q8K2I9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fbxo18Q8K2I9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fbxo18Q8K2I9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fbxo18Q8K2I9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Fbxo18Q8K2I9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fbxo18Q8K2I9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fbxo18Q8K2I9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fbxo18Q8K2I9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fbxo18Q8K2I9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fbxo18Q8K2I9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fbxo18Q8K2I9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fbxo18Q8K2I9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fbxo18Q8K2I9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fbxo18Q8K2I9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fbxo18Q8K2I9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fbxo18Q8K2I9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Fbxo18Q8K2I9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fbxo18Q8K2I9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fbxo18Q8K2I9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fbxo18Q8K2I9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fbxo18Q8K2I9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Fbxo18Q8K2I9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fbxo18Q8K2I9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fbxo18Q8K2I9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fbxo18Q8K2I9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fbxo18Q8K2I9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fbxo18Q8K2I9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fbxo18Q8K2I9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fbxo18Q8K2I9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Fbxo18Q8K2I9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fbxo18Q8K2I9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fbxo18Q8K2I9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fbxo18Q8K2I9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fbxo18Q8K2I9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fbxo18Q8K2I9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fbxo18Q8K2I9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fbxo18Q8K2I9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fbxo18Q8K2I9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fbxo18Q8K2I9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fbxo18Q8K2I9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fbxo18Q8K2I9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fbxo18Q8K2I9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fbxo18Q8K2I9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fbxo18Q8K2I9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fbxo18Q8K2I9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fbxo18Q8K2I9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fbxo18Q8K2I9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fbxo18Q8K2I9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fbxo18Q8K2I9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fbxo18Q8K2I9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fbxo18Q8K2I9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Fbxo18Q8K2I9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fbxo18Q8K2I9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fbxo18Q8K2I9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fbxo18Q8K2I9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fbxo18Q8K2I9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fbxo18Q8K2I9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fbxo18Q8K2I9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fbxo18Q8K2I9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fbxo18Q8K2I9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms