Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Depp1Q8K2F3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms