Protein–RNA interactions for Protein: Q8K299

Scara5, Scavenger receptor class A member 5, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara5Q8K299 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Scara5Q8K299 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scara5Q8K299 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scara5Q8K299 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scara5Q8K299 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scara5Q8K299 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scara5Q8K299 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scara5Q8K299 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scara5Q8K299 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scara5Q8K299 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scara5Q8K299 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scara5Q8K299 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scara5Q8K299 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scara5Q8K299 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scara5Q8K299 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scara5Q8K299 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scara5Q8K299 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scara5Q8K299 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scara5Q8K299 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scara5Q8K299 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scara5Q8K299 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scara5Q8K299 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scara5Q8K299 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scara5Q8K299 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scara5Q8K299 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scara5Q8K299 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scara5Q8K299 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scara5Q8K299 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scara5Q8K299 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scara5Q8K299 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scara5Q8K299 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scara5Q8K299 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scara5Q8K299 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scara5Q8K299 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scara5Q8K299 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scara5Q8K299 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scara5Q8K299 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scara5Q8K299 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scara5Q8K299 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scara5Q8K299 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scara5Q8K299 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scara5Q8K299 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Scara5Q8K299 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scara5Q8K299 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scara5Q8K299 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scara5Q8K299 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scara5Q8K299 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Scara5Q8K299 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scara5Q8K299 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scara5Q8K299 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scara5Q8K299 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scara5Q8K299 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scara5Q8K299 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scara5Q8K299 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scara5Q8K299 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scara5Q8K299 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scara5Q8K299 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scara5Q8K299 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scara5Q8K299 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Scara5Q8K299 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scara5Q8K299 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scara5Q8K299 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scara5Q8K299 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scara5Q8K299 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Scara5Q8K299 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scara5Q8K299 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Scara5Q8K299 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scara5Q8K299 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scara5Q8K299 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scara5Q8K299 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scara5Q8K299 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scara5Q8K299 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Scara5Q8K299 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scara5Q8K299 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Scara5Q8K299 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scara5Q8K299 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scara5Q8K299 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scara5Q8K299 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scara5Q8K299 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scara5Q8K299 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Scara5Q8K299 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scara5Q8K299 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scara5Q8K299 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scara5Q8K299 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scara5Q8K299 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scara5Q8K299 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scara5Q8K299 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scara5Q8K299 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scara5Q8K299 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scara5Q8K299 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scara5Q8K299 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scara5Q8K299 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scara5Q8K299 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scara5Q8K299 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scara5Q8K299 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scara5Q8K299 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scara5Q8K299 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scara5Q8K299 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scara5Q8K299 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scara5Q8K299 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms