Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E0

Stx5, Syntaxin-5, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx5Q8K1E0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Stx5Q8K1E0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx5Q8K1E0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx5Q8K1E0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx5Q8K1E0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx5Q8K1E0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx5Q8K1E0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx5Q8K1E0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx5Q8K1E0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx5Q8K1E0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx5Q8K1E0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx5Q8K1E0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx5Q8K1E0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx5Q8K1E0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx5Q8K1E0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx5Q8K1E0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx5Q8K1E0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx5Q8K1E0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx5Q8K1E0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx5Q8K1E0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx5Q8K1E0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx5Q8K1E0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx5Q8K1E0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx5Q8K1E0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx5Q8K1E0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx5Q8K1E0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx5Q8K1E0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx5Q8K1E0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx5Q8K1E0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx5Q8K1E0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx5Q8K1E0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx5Q8K1E0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx5Q8K1E0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx5Q8K1E0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx5Q8K1E0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx5Q8K1E0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx5Q8K1E0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx5Q8K1E0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx5Q8K1E0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx5Q8K1E0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx5Q8K1E0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx5Q8K1E0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx5Q8K1E0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx5Q8K1E0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx5Q8K1E0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx5Q8K1E0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms