Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIC2

Nupl2, Nucleoporin-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nupl2Q8CIC2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms