Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9C9

4930507D05Rik, RIKEN cDNA 4930507D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930507D05RikQ8C9C9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930507D05RikQ8C9C9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930507D05RikQ8C9C9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930507D05RikQ8C9C9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930507D05RikQ8C9C9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
4930507D05RikQ8C9C9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930507D05RikQ8C9C9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930507D05RikQ8C9C9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930507D05RikQ8C9C9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930507D05RikQ8C9C9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930507D05RikQ8C9C9 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930507D05RikQ8C9C9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930507D05RikQ8C9C9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930507D05RikQ8C9C9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930507D05RikQ8C9C9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930507D05RikQ8C9C9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930507D05RikQ8C9C9 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930507D05RikQ8C9C9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930507D05RikQ8C9C9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930507D05RikQ8C9C9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930507D05RikQ8C9C9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930507D05RikQ8C9C9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930507D05RikQ8C9C9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930507D05RikQ8C9C9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930507D05RikQ8C9C9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930507D05RikQ8C9C9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
4930507D05RikQ8C9C9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930507D05RikQ8C9C9 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930507D05RikQ8C9C9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930507D05RikQ8C9C9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930507D05RikQ8C9C9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930507D05RikQ8C9C9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930507D05RikQ8C9C9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930507D05RikQ8C9C9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930507D05RikQ8C9C9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930507D05RikQ8C9C9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930507D05RikQ8C9C9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.4 ms