Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms