Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3B8

Rft1, Protein RFT1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rft1Q8C3B8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rft1Q8C3B8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rft1Q8C3B8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rft1Q8C3B8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rft1Q8C3B8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rft1Q8C3B8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rft1Q8C3B8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rft1Q8C3B8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rft1Q8C3B8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rft1Q8C3B8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rft1Q8C3B8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rft1Q8C3B8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rft1Q8C3B8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rft1Q8C3B8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rft1Q8C3B8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rft1Q8C3B8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rft1Q8C3B8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rft1Q8C3B8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rft1Q8C3B8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rft1Q8C3B8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rft1Q8C3B8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rft1Q8C3B8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rft1Q8C3B8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rft1Q8C3B8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rft1Q8C3B8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rft1Q8C3B8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rft1Q8C3B8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rft1Q8C3B8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rft1Q8C3B8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rft1Q8C3B8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rft1Q8C3B8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rft1Q8C3B8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rft1Q8C3B8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rft1Q8C3B8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rft1Q8C3B8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rft1Q8C3B8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rft1Q8C3B8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rft1Q8C3B8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rft1Q8C3B8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rft1Q8C3B8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rft1Q8C3B8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rft1Q8C3B8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rft1Q8C3B8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rft1Q8C3B8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rft1Q8C3B8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rft1Q8C3B8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rft1Q8C3B8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rft1Q8C3B8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rft1Q8C3B8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rft1Q8C3B8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rft1Q8C3B8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rft1Q8C3B8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rft1Q8C3B8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rft1Q8C3B8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rft1Q8C3B8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rft1Q8C3B8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rft1Q8C3B8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rft1Q8C3B8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rft1Q8C3B8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rft1Q8C3B8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rft1Q8C3B8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rft1Q8C3B8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rft1Q8C3B8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rft1Q8C3B8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rft1Q8C3B8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rft1Q8C3B8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rft1Q8C3B8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rft1Q8C3B8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rft1Q8C3B8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rft1Q8C3B8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rft1Q8C3B8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rft1Q8C3B8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rft1Q8C3B8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rft1Q8C3B8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rft1Q8C3B8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rft1Q8C3B8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rft1Q8C3B8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rft1Q8C3B8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rft1Q8C3B8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms