Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q9

Rapgef5, Rap guanine nucleotide exchange factor 5, mousemouse

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Length 814 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef5Q8C0Q9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rapgef5Q8C0Q9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rapgef5Q8C0Q9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rapgef5Q8C0Q9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Rapgef5Q8C0Q9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rapgef5Q8C0Q9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Rapgef5Q8C0Q9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rapgef5Q8C0Q9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rapgef5Q8C0Q9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Rapgef5Q8C0Q9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Rapgef5Q8C0Q9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Rapgef5Q8C0Q9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Rapgef5Q8C0Q9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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Rapgef5Q8C0Q9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rapgef5Q8C0Q9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rapgef5Q8C0Q9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rapgef5Q8C0Q9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rapgef5Q8C0Q9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rapgef5Q8C0Q9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rapgef5Q8C0Q9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Rapgef5Q8C0Q9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Rapgef5Q8C0Q9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rapgef5Q8C0Q9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rapgef5Q8C0Q9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rapgef5Q8C0Q9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rapgef5Q8C0Q9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rapgef5Q8C0Q9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rapgef5Q8C0Q9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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