Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms