Protein–RNA interactions for Protein: Q8BZW8

Nhlrc2, NHL repeat-containing protein 2, mousemouse

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Length 725 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc2Q8BZW8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nhlrc2Q8BZW8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nhlrc2Q8BZW8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nhlrc2Q8BZW8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nhlrc2Q8BZW8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nhlrc2Q8BZW8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nhlrc2Q8BZW8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nhlrc2Q8BZW8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms