Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ7

Gabra5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra5Q8BHJ7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms