Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW3

Bhlhe23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe23Q8BGW3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms