Protein–RNA interactions for Protein: Q80UK0

Sestd1, SEC14 domain and spectrin repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sestd1Q80UK0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sestd1Q80UK0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sestd1Q80UK0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sestd1Q80UK0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sestd1Q80UK0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sestd1Q80UK0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sestd1Q80UK0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sestd1Q80UK0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sestd1Q80UK0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sestd1Q80UK0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sestd1Q80UK0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sestd1Q80UK0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sestd1Q80UK0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sestd1Q80UK0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sestd1Q80UK0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sestd1Q80UK0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sestd1Q80UK0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sestd1Q80UK0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sestd1Q80UK0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sestd1Q80UK0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sestd1Q80UK0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sestd1Q80UK0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sestd1Q80UK0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sestd1Q80UK0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sestd1Q80UK0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sestd1Q80UK0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sestd1Q80UK0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sestd1Q80UK0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sestd1Q80UK0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sestd1Q80UK0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sestd1Q80UK0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sestd1Q80UK0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sestd1Q80UK0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sestd1Q80UK0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sestd1Q80UK0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sestd1Q80UK0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sestd1Q80UK0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sestd1Q80UK0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Sestd1Q80UK0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sestd1Q80UK0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sestd1Q80UK0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sestd1Q80UK0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sestd1Q80UK0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sestd1Q80UK0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sestd1Q80UK0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sestd1Q80UK0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sestd1Q80UK0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sestd1Q80UK0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sestd1Q80UK0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sestd1Q80UK0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sestd1Q80UK0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sestd1Q80UK0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sestd1Q80UK0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sestd1Q80UK0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sestd1Q80UK0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sestd1Q80UK0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sestd1Q80UK0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Sestd1Q80UK0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sestd1Q80UK0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Sestd1Q80UK0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sestd1Q80UK0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sestd1Q80UK0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sestd1Q80UK0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sestd1Q80UK0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sestd1Q80UK0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sestd1Q80UK0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sestd1Q80UK0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sestd1Q80UK0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sestd1Q80UK0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sestd1Q80UK0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sestd1Q80UK0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sestd1Q80UK0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Sestd1Q80UK0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Sestd1Q80UK0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sestd1Q80UK0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sestd1Q80UK0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sestd1Q80UK0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sestd1Q80UK0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sestd1Q80UK0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sestd1Q80UK0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sestd1Q80UK0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sestd1Q80UK0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sestd1Q80UK0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sestd1Q80UK0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sestd1Q80UK0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sestd1Q80UK0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sestd1Q80UK0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sestd1Q80UK0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sestd1Q80UK0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sestd1Q80UK0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Sestd1Q80UK0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sestd1Q80UK0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sestd1Q80UK0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sestd1Q80UK0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sestd1Q80UK0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sestd1Q80UK0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sestd1Q80UK0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sestd1Q80UK0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sestd1Q80UK0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sestd1Q80UK0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms