Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Avl9Q80U56 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Avl9Q80U56 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Avl9Q80U56 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Avl9Q80U56 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Avl9Q80U56 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Avl9Q80U56 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Avl9Q80U56 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Avl9Q80U56 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Avl9Q80U56 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Avl9Q80U56 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Avl9Q80U56 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Avl9Q80U56 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Avl9Q80U56 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Avl9Q80U56 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Avl9Q80U56 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Avl9Q80U56 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Avl9Q80U56 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Avl9Q80U56 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Avl9Q80U56 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Avl9Q80U56 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Avl9Q80U56 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Avl9Q80U56 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Avl9Q80U56 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Avl9Q80U56 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Avl9Q80U56 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Avl9Q80U56 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Avl9Q80U56 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Avl9Q80U56 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Avl9Q80U56 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Avl9Q80U56 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Avl9Q80U56 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Avl9Q80U56 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Avl9Q80U56 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Avl9Q80U56 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Avl9Q80U56 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Avl9Q80U56 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Avl9Q80U56 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Avl9Q80U56 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Avl9Q80U56 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Avl9Q80U56 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Avl9Q80U56 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Avl9Q80U56 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Avl9Q80U56 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Avl9Q80U56 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Avl9Q80U56 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Avl9Q80U56 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Avl9Q80U56 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Avl9Q80U56 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Avl9Q80U56 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Avl9Q80U56 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Avl9Q80U56 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Avl9Q80U56 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Avl9Q80U56 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Avl9Q80U56 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Avl9Q80U56 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Avl9Q80U56 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Avl9Q80U56 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Avl9Q80U56 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Avl9Q80U56 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Avl9Q80U56 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Avl9Q80U56 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Avl9Q80U56 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Avl9Q80U56 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Avl9Q80U56 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Avl9Q80U56 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Avl9Q80U56 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Avl9Q80U56 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Avl9Q80U56 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Avl9Q80U56 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Avl9Q80U56 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Avl9Q80U56 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Avl9Q80U56 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Avl9Q80U56 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Avl9Q80U56 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Avl9Q80U56 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Avl9Q80U56 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Avl9Q80U56 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Avl9Q80U56 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Avl9Q80U56 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Avl9Q80U56 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms