Protein–RNA interactions for Protein: Q80T74

Klhl29, Kelch-like protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl29Q80T74 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klhl29Q80T74 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klhl29Q80T74 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klhl29Q80T74 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klhl29Q80T74 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klhl29Q80T74 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klhl29Q80T74 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klhl29Q80T74 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klhl29Q80T74 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klhl29Q80T74 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klhl29Q80T74 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klhl29Q80T74 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klhl29Q80T74 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klhl29Q80T74 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klhl29Q80T74 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klhl29Q80T74 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klhl29Q80T74 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Klhl29Q80T74 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klhl29Q80T74 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klhl29Q80T74 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klhl29Q80T74 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klhl29Q80T74 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klhl29Q80T74 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klhl29Q80T74 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klhl29Q80T74 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klhl29Q80T74 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klhl29Q80T74 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klhl29Q80T74 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klhl29Q80T74 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klhl29Q80T74 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klhl29Q80T74 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klhl29Q80T74 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klhl29Q80T74 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klhl29Q80T74 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klhl29Q80T74 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klhl29Q80T74 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klhl29Q80T74 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klhl29Q80T74 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klhl29Q80T74 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klhl29Q80T74 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klhl29Q80T74 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klhl29Q80T74 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klhl29Q80T74 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klhl29Q80T74 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klhl29Q80T74 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klhl29Q80T74 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klhl29Q80T74 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klhl29Q80T74 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klhl29Q80T74 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klhl29Q80T74 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klhl29Q80T74 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klhl29Q80T74 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klhl29Q80T74 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klhl29Q80T74 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klhl29Q80T74 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Klhl29Q80T74 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klhl29Q80T74 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klhl29Q80T74 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Klhl29Q80T74 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klhl29Q80T74 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klhl29Q80T74 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klhl29Q80T74 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klhl29Q80T74 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klhl29Q80T74 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klhl29Q80T74 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl29Q80T74 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl29Q80T74 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl29Q80T74 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl29Q80T74 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl29Q80T74 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl29Q80T74 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl29Q80T74 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl29Q80T74 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl29Q80T74 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl29Q80T74 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl29Q80T74 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl29Q80T74 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl29Q80T74 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl29Q80T74 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl29Q80T74 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl29Q80T74 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl29Q80T74 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl29Q80T74 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl29Q80T74 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl29Q80T74 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl29Q80T74 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl29Q80T74 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl29Q80T74 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl29Q80T74 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl29Q80T74 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl29Q80T74 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl29Q80T74 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl29Q80T74 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl29Q80T74 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl29Q80T74 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl29Q80T74 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl29Q80T74 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl29Q80T74 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl29Q80T74 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl29Q80T74 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms