Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms